বাচ্চাদের কিডনি, মুত্রনালি ও অণ্ডকোষের জন্মগত সমস্যার মধ‍্যে রয়েছে কিডনীর মুখে ব্লক (PUJ Obstruction), ডাবল কিডনী নালী (Duplex ureter), মুত্রলানী ও মুত্রথলির সংযোগস্থলে ব্লক (VUJ Obstruction). প্রসাবের রাস্তায় পর্দা ( PUV), হাইপোসপেডিয়াস, ফাইমোসিস, ইপিসপেডিয়াস, অন্ডকোষ থলিতে না থাকা (undescended testis) , জন্মগত হার্নিয়া ইত‍্যাদি।